近日,国家卫健委临床检验中心公布了“2020年全国下呼吸道感染宏基因组测序室间质量评价预研活动”结果。杭州迪安医学检验中心首次采用三代测序技术——纳米孔单分子测序技术参评,并顺利通过。
这体现了NCCL对迪安诊断实验室在操作规范、流程控制、质量监督等各个方面工作的肯定,也验证了迪安运用纳米孔单分子测序技术方法的准确性和可靠性。
第三代测序技术又称单分子测序技术(single molecule sequencing),是在第二代测序技术读长限制和依赖PCR模板扩增的基础上发展而来。目前,应用较广泛的是单分子实时测序技术(SMRT)和纳米孔单分子测序技术(Nanopore)。
纳米孔单分子测序技术设计了一个允许单个DNA/RNA分子通过的纳米孔道,并在膜两侧施加不同电压差,DNA双链在马达蛋白的牵引下,被解螺旋并被引导通过纳米孔,DNA单链上不同的碱基会形成特征性离子电流变化信号。不同的碱基和碱基表面不同的化学修饰基团,都将影响流过纳米孔的电流强度。通过检测电流强度的变化,可以判断出碱基的种类和甲基化等化学修饰。
采用纳米孔单分子测序技术应对宏基因组分析,具有“快速、实时、长度长”的病原体鉴定与抗微生物药物耐药性分析优势,通过建立去宿主样本前处理方法,能有效提高病原体测序有效数据比例,在不明原因感染的诊断中应用前景广阔。
纳米孔单分子测序技术应用于感染检测的优势:
更精确鉴定菌种:长读长提高对比准确性,同时检测细菌、真菌、病毒、古生菌等;
可分析耐药性:独有覆盖90-95%细菌/真菌耐药数据库;
高时效性:6h完成检测出具报告,院内检测,无需外送,无需凑样;
投入较低:硬件投入少,实验室场地要求低,容易实现院内检测;
操作便捷:操作分析简单,对人员要求低。
迪谱诊断致力于核酸质谱检测系统与纳米孔单分子测序技术等高端基因检测技术的研发生产,推动新技术在传染病、药物基因组学、遗传病、肿瘤、健康管理等领域的应用推广,努力成为全球领先的高端基因解析产品制造者;迪安研发中心基于纳米孔单分子测序平台(GridION Mk1 /MinION/ MinION Mk1C),已开发了Nano-seq病原体宏基因组检测方法。